一般而言，各编辑部都会有一个采编系统，作者会将稿件通过投稿邮箱或者邮寄等方式寄到编辑部来，由系统统一进行整理和归类。

当然还会有人工进行审核，审核通过之后才能进入到编辑手中进行编辑和校对，其中会与作者本人进行联系以修改文章中存在的错误，直至印刷出版。

这其中会经过学术不端文献检测系统的检查，也就是检查是否存在抄袭、一稿多投等情况。如果发现这一情况，会添加到学术不端文献检测系统的黑名单里。

这样一来，中间就会出现各种各样的问题，比如工作效率低下，时间紧张导致延期出版或者耽误相关科研项目，作者被代理收取高额的中介费等情况。更重要的是，由于部分代理本身没有文献检测系统或者为谋求私利，很容易出现向多家编辑部投稿的情况。
另外，还接触到过的问题是第一作者和第二作者共同完成论文，而用颠倒作者顺序的方式进行一稿多投，而且这其中的某一作者根本不知情。即作者在不知情的情况下，论文被其他人抢先发表了。
还有一个作者是某科研项目的负责人，其所研究的科研项目内容相互关联，尽管方向不同，但是实验方式和结果结论等有多处重合。
以上所述，主要是想说明，尽管会被检测出有抄袭、一稿多投等情况，但并非绝大多数是故意的。如果不查明事实就标注在黑名单上，很容易造成冤假错案。